Например был у вас домен http://moysait.ru и ссылки ваших материалов ранее были таком виде http://moysait.ru/moydomen, поисковиками они также индексировались, и в результатах продолжают выдавать такие ссылки. Если вы сменили домен, то прежние ссылки уже не работают. И также вы теряете посетителей которые могли к вам попасть с результатов выдачи поисковиков.
Я не спец в СЕО но проблему решил следующим образом, сайт был на CMS Joomla! 1.5, в начале сохранил каталог прежнего домена и в нем создал .htaccess с параметром:
Redirect / http://newdomaine.net/
Ссылка это ваш новый домен, слеш в конце обязателен иначе старые ссылки не корректно будут переадресовываться. Если у вас ранее был включен SEF и ссылки были укорочены, то его также нужно включить на сайте с новым доменом. В результате должно получится что при вводе какого нибудь ключевого слова в поисковике, поисковик выдаст ваши ссылки со старым доменом, кликая по ним вы должны оказаться на сайта с новым доменом и на том же материале.
После не забудьте принять необходимые меры по внесению корректировок в ваши СЕО инструменты. Например, вскормите карту сайта поисковикам с новым доменом.
P.S. Если у вас есть советы к данной теме очень был бы рад, так как я не спец в сео и возможно много важного упустил.
